猪流行性腹泻病毒（PEDV）是全球养猪业的重要病原体。自2010年前，CV777疫苗的使用使经典毒株消失。然而，自2010年后，中国出现了GII型疫情，其仔猪死亡率超过90%，揭示经典疫苗的效力不足。这一现象表明，病毒可能通过抗原漂移或重组逃逸免疫，具体机制尚待深入研究。2025年7月2日，西北农科大学与兰州兽医研究所的研究团队在《BMC Vet Res》期刊上发表了基于1109株PEDV毒株的研究，揭示了S基因突变、重组热点及糖基化变异，为疫苗研发提供了关键支持。研究结果显示，GII型毒株（占8738%）通过COE区的高频突变（如L521H）、Domain0重组热点及N62/N118糖基化变异，增强了受体结合与免疫逃逸能力，推动了PEDV的进化与传播。

引言：基于1109株PEDV毒株的S基因分析发现：GII型毒株占主导地位（GIIa/b/c合计超过85%），该毒株通过“唾液酸结合+免疫逃逸”双重策略进化。其重组热点（D0结构域）和特殊的糖基化模式（N62/N118位点）为跨物种传播提供了重要依据，这为疫苗优化及区域防控奠定了基础。

研究结果： 1. GII型毒株占据绝对优势：系统发育树表明，中国的PEDV毒株分为GI（经典）和GII（变异）两个进化支系，共有六个亚型。2010年后，GII型成为主要流行株，其中GIIa的比例自2014年开始逐渐下降，而GIIc则持续上升，GIIb稳定不变，这两者构成当前的主要流行毒株。

2. S蛋白的氨基酸突变：通过比较各毒株的S蛋白中和表位，发现在COE区域存在L521H、S523G等8个高频突变及跨亚型的A517S变异；SS6区域则主要出现Y766S突变。GIIa毒株在608-609位点发生关键插入。SS2与2C10表位高度保守，显示病毒通过靶向表位的突变逃逸免疫压力。

3. 重组分析：研究发现，重组是PEDV病毒进化的关键驱动力。近年来，PEDV毒株S基因中的重组事件主要来自GII型毒株，GIb重组毒株多为GI与GII毒株的重组，其重组区域通常包含Domain0；GIIb重组毒株主要由不同GIIb毒株的重组产生，大多数覆盖HR2、TM和Domain0，GIIc重组毒株则包括来自GIIb的重组与GIa与GIIb的重组，其重组区域同样涵盖Domain0。

4. N-糖基化位点变异的研究显示，N-糖基化对PEDV的进入和免疫逃逸非常重要。GI型（GIa/GIb/S-INDEL）毒株的糖基化模式与CV777相似且没有新增位点，而GII型则出现位于Domain0的新增高特异性糖基化位点（N62、N118），可能影响病毒与宿主的相互作用及免疫识别。

总结：本研究揭示中国PEDV病毒呈现三大进化特征：GII型毒株通过D0结构域突变实现“高唾液酸亲和力+免疫逃逸”双重优势，重组热点集中于D0区域推动适应性进化，以及N62/N118位点的糖基化修饰介导免疫逃逸。因此，建议针对性防控策略，包括开发靶向去糖基化表位的多价mRNA疫苗、建立基于重组热点的监测体系，以及评估跨物种传播的风险。

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