通过体外转录(IVT)生成的mRNA反应混合物中,除了所需的mRNA产物外,还包含诸如T7 RNA聚合酶、无机焦磷酸酶、NTP、模板DNA、盐离子、添加剂以及IVT过程中生成的mRNA副产物(如dsRNA、截断RNA片段)等杂质。这些杂质可能对mRNA的功能产生不利影响,进而影响其定量、翻译效率和免疫原性。因此,使用纯化技术将目标mRNA从IVT混合物中分离出来,以确保其纯度和完整性是至关重要的,这样可以提高产品的安全性和有效性。
常见的mRNA纯化方法
当前常用的mRNA纯化技术包括氯化锂沉淀、硫酸铵沉淀、磁珠纯化、硅胶柱膜纯化和层析法等。沉淀、磁珠和硅胶柱等方法操作简单快捷,适合科研和早期应用场景,但在工业生产中,层析法则更为主流。
氯化锂沉淀法
氯化锂沉淀法为传统的mRNA纯化方法,利用锂离子在特定pH条件下减小RNA分子之间的同电性相斥,从而促进RNA聚集形成沉淀。然而,由于锂盐的毒性和操作条件的特殊要求,这一方法在工业应用时面临一定的局限。通常建议仅针对300nt以上或浓度至少为400µg/ml的RNA样品使用此法。
硫酸铵沉淀法
2024年,来自中科院过程工程研究所的研究探讨了硫酸铵沉淀法对mRNA的纯化效果。当硫酸铵浓度达到18M时,mRNA的沉淀率超过95%。最佳的沉淀条件为2M硫酸铵(AS),pH 7.0,20℃,沉淀时间2小时,沉淀率和溶出率均可接近100%。该方法在室温下操作,适合工业用途。
硅胶柱膜纯化
硅胶柱膜纯化方法利用硅胶表面的化学基团与mRNA的相互作用来实现纯化。这种方法能够高效去除蛋白质、多糖等杂质,且因其材料安全无毒,更符合环保理念,广泛应用于实验室和早期研究阶段。
磁珠法
磁珠法通过修饰的磁珠与mRNA结合,在磁场下分离。该方法相对于氯化锂沉淀法具备更高的纯化效率,但在使用条件上需谨慎,以保证mRNA的完整性。
层析法的应用
层析法是工业级纯化的主要方法,常见的有Oligo(dT)亲和层析、疏水层析和阴离子层析等。Oligo(dT)亲和层析能够高效识别带Poly(A)尾的mRNA,并去除其他杂质;疏水层析和阴离子层析则针对特定杂质进行优化,以提高mRNA的纯度和回收率。
尊龙凯时的mRNA纯化服务
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