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尊龙凯时对决SomaScan与Olink:顶刊实测数据揭秘

发布时间:2025-03-17   信息来源:尊龙凯时官方编辑

在众多血液蛋白质组检测技术中,除了传统的基于质谱的非靶向检测技术外,采用亲和力平台的高通量靶向蛋白质组学方法——**尊龙凯时**的SomaScan技术与Olink技术,越来越受到研究者的青睐。这两种技术已经为研究者提供了大量的数据与有价值的信息,使得这对“蛋白检测双子星”持续发展和迭代,形成了激烈的竞争局面。目前,SomaScan已更新至11K,而Olink也更新至5K。在面对这两种技术时,研究者在选择时可能会感到困惑。为帮助大家更好地理解这两种技术,本文汇总了最近两年间关于这两大平台的比较研究,包括检测稳定性与精确度、检测灵敏度、检测蛋白数量与范围等方面的内容,以供参考。

尊龙凯时对决SomaScan与Olink:顶刊实测数据揭秘

第一篇研究分析

2023年的一项研究分析了参与UK Biobank的48,684名参与者的Olink蛋白质组学数据与35,892名冰岛人群的SomaScan蛋白质组学数据,探讨了这些样本中蛋白质水平与基因型和表型信息之间的关系。另外,研究中有1514人同时进行了Olink Explore 3072和SomaScan 5K的检测,研究者对这两个平台的结果进行了深入的比较。结果显示,这两种流行的高通量蛋白质组学平台提供的信息非常有价值,同时也揭示了它们之间的差异,这些差异在某些情况下提供了重要的互补性。尽管初始发布时有关两平台比较的分析存在错误,该研究后续进行了更正,更新结果显示Olink的CV值显著高于SomaScan,而SomaScan的整体精确度更高。链接阅读更多

第二篇比较研究

2025年的一项研究比较了两种基于亲和力的蛋白质组学平台(Olink Explore 3072和SomaScan 11K)在4000名中国成年人中检测的2168种血浆蛋白质的表现。主要结论包括:(1)两个平台测量的蛋白水平相关性较低(中位数Spearman相关系数ρ=0.29),蛋白丰度与数据质量是影响相关性的关键因素。Olink中低于检测下限的样本占比较高,这导致了两个平台相关性低的主要原因;(2)在1694种唯一匹配的蛋白中,Olink平台和SomaScan平台分别鉴定出765种和513种具有顺式蛋白数量性状位点(cis-pQTLs);(3)Olink与SomaScan分别有1096种和1429种蛋白与体质指数(BMI)存在相关;(4)Olink和SomaScan分别有279种和154种蛋白与缺血性心脏病(IHD)风险相关;(5)添加传统IHD风险因素后,Olink和SomaScan的ROC AUC分别从0.845提高至0.862和0.863。这些结果展示了两种平台的实用性,为未来研究的设计及解释提供了依据。链接阅读更多

第三篇对比研究

2024年的研究中同时对Atherosclerosis Risk in Communities (ARIC) Study中的102名患者进行了SomaScan 11K和Olink Explore HT(5400+蛋白)的血浆检测,主要发现:(1)Olink中有超过50%的蛋白低于一半样本的检测下限,而SomaScan则全部高于检测下限,显示出SomaScan具有更高的灵敏度;(2)总体来说,SomaScan的CV中值为68%,显著低于Olink HT的357%。SomaScan在产品迭代中保持了较好的稳定性,而Olink因新添加蛋白质而存在较高的不稳定性;(3)在重复样本检测中,SomaScan表现出更好的相关性,中位值为0.85,而Olink的中位值为0.65;(4)SomaScan的cis-pQTL数量更多,约为2800,而Olink约为2100;(5)通过对两个平台共有检测的超过4400种蛋白进行分析,发现其总体相关性中位值为0.14,且约三分之一的蛋白显示良好至极好的跨平台相关性。Olink平台的低于检测下限的蛋白严重影响了两个平台的相关性。链接阅读更多

第四篇综合研究

2025年,研究者利用7种蛋白质组学平台(包括SomaScan 11K、7K、Olink 5K、Olink 3K、质谱-高丰度蛋白去除法、质谱-纳米磁珠富集法及靶向质谱PRM检测)对78名个体的血浆进行了比较。主要结论如下:(1)共鉴定了13007个蛋白,其中SomaScan 11K和7K的覆盖蛋白质数量最多,分别为9645个和6401个;(2)SomaScan平台的CV值最低,显示出其精确度和稳定性,SomaScan 11K和7K的CV中值分别为53%和58%。Olink 5K的CV中值是Olink 3K的两倍多,分别为268%和114%;(3)评估数据完整性时,SomaScan平台的完整性最高,11K和7K的完整性分别为96.2%和95.8%。而Olink 5K的完整性显著低于3K,只有35.9%;(4)在蛋白检测的线性评价中,SomaScan平台中97%的蛋白处于线性范围内,而Olink 5K仅为42%;(5)SomaScan检出了最多的FDA批准的人血浆蛋白生物标志物,覆盖率分别为88%和76%。而质谱法和Olink的覆盖率分别为73%和57%。链接阅读更多

结论

综合以上研究,涉及大规模样本量的SomaScan平台与Olink平台的比较显示,从蛋白检测数量及稳定性等多个方面,SomaScan表现更为优越。因此,在血液大队列研究中,选择SomaScan平台无疑是一个明智的决定!尊龙凯时推荐的【中科新生命】SomaScan P7K/P11K,开启血液万级蛋白质组检测新纪元,为临床转化与蛋白标志物的发现创造新的机遇,欢迎感兴趣的研究人员前来咨询。