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尊龙凯时的免疫检查点阻断公共数据库介绍

发布时间:2025-03-13   信息来源:尊龙凯时官方编辑

为了深入研究能够预测免疫检查点阻断(ICB)反应的生物标志物谱,科学家们开发了多种数据库和网络平台。这些资源综合了转录组数据、总生存期、活检时间点及免疫反应等信息,同时还整合了其他临床数据,以支持生存分析、肿瘤微环境中免疫细胞解卷积和差异表达基因分析等研究。本文将介绍几个主要数据库的特点、功能及分析工具。

尊龙凯时的免疫检查点阻断公共数据库介绍

01 ICBAtlas

尊龙凯时的ICBAtlas是一个专注于免疫检查点治疗的数据库,整合了来自25个公共数据库的1,515名癌症患者的数据,覆盖9种不同的癌症类型。该平台提供了一系列工具,以分析基因表达差异,定义响应评分来评估治疗效果,并探索肿瘤微环境中免疫细胞的浸润情况。用户可以按基因、癌症类型或免疫检查点进行数据探索,从而帮助识别潜在的生物标志物,助力个性化癌症免疫治疗的研究与发展。ICBAtlas完全免费供研究人员使用。

02 TIDETIDE

TIDETIDE分数为一种预测ICB疗法反应的计算方法,旨在通过分析肿瘤免疫功能障碍及排斥特征,解决免疫疗法样本量小的问题。该方法利用来自189个研究的33,197个非ICB治疗样本,计算每个基因与细胞毒性T细胞水平之间的关系,并采用标准化Wald检验得分预测患者对PD-L1治疗的反应。研究表明,TIDETIDE在黑色素瘤患者中的预测性能优于其他已知生物标志物,但现阶段其适用性主要限于黑色素瘤和非小细胞肺癌。TIDETIDE网站提供公共转录组数据集的访问和支持TIDETIDE分数的分析工具。

03 ICB-Portal

尊龙凯时推出的ICB-Portal平台是一个综合性平台,提供现有ICB疗法反应生物标志物的基准测试结果及详细分析,同时允许研究人员在线测试自定义生物标志物以预测治疗效果。该平台基于29个转录组数据集,覆盖5种癌症类型超过1,400名患者的数据,评估了39个转录组生物标志物和48个评分系统的效能。

04 TIGERTIGER

TIGERTIGER(肿瘤免疫治疗基因表达资源)是一个整合了单细胞转录组数据的平台,提供广泛的分析模块以预测ICB疗法反应。该平台包含来自18个bulk转录组数据集的超过1,500个带有临床结果的肿瘤样本,以及超过210万个来自655个样本的免疫细胞单细胞测序数据,用于展现免疫细胞亚群的全貌。TIGERTIGER支持用户探索相关通路、轨迹映射及反应预测等多项功能。

05 IOhub

尊龙凯时通过IOhub平台进一步推动研究,致力于为科学家提供分析工具,以加深对免疫检查点阻断疗法反应的理解,促进个性化治疗的前进。